Depuis que les Filles de Marie et de Joseph (FMJ) sont arrivées au Burundi en 1930 comme missionnaires, elles ont servi l'Eglise et la Nation dans les secteurs de l'éducation, de la catéchèse, de la santé et du travail social. Leur premier lieu de mission était dans le Nord du Burundi, en particulier dans le Diocèse de Ngozi et Muyinga. Au Burundi, les FMJ sont principalement connues comme des éducatrices et elles continuent à appliquer leur charisme d’ "Etre des Instruments de la Miséricorde de Dieu’’ pour les pauvres, les marginalisés et ceux qui sont dans le besoin.

Les Filles de Marie et de Joseph au Burundi sont appréciées par l'Eglise et la Nation pour leur contribution à l'éducation dans la société et à l'évangélisation. Dans le pays, elles ont servi le peuple de Dieu sans tenir compte des différences confessionnelles.

Pendant de nombreuses années, les Filles de Marie et de Joseph ont bien géré leurs institutions avec diligence. Beaucoup des jeunes filles qui ont passées dans les mains des FMJ  ont reçu une bonne éducation qui a fait d'elles des dames responsables aujourd'hui. Certaines d'entre elles sont devenues Associées des FMJ.